四川大学华西第二医院源于1896年成立的仁济女医院，1912年定名仁济妇孺医院，开设妇产科和儿科。1987年卫生部批准华西妇产科和儿科从原华西医科大学附属第一医院迁出单独建院，成立华西医科大学附属第二医院，又名华西妇产儿童医院。2000年医院更名为“四川大学华西第二医院/华西妇产儿童医院”，是卫生部预算管理单位和全国首批“三级甲等”妇女儿童专科医院，是集医疗、教学、科研、预防保健和人才培养为一体的大学附属医院。1993年被卫生部、联合国儿童基金会和世界卫生组织授予“爱婴医院”称号，1998年被评为国家“三级甲等妇产儿童专科医院”，2003年被全国总工会授予“全国女职工先进集体”称号，2008年被全国总工会授予“抗震救灾，重建家园工人先锋号”旗帜，2009年被全国总工会授予“全国五一劳动奖状”，2012年获“全国三八红旗集体”称号。
　　医院现有编制床位600张，建筑面积5.9万平方米，医疗业务用房面积4.1万平方米，拥有15个临床科室和5个医技科室。妇产科学和儿科学均为国家重点学科，儿科学为国家精品课程，妇科、产科、儿科新生儿专业为国家临床重点专科建设项目。医院拥有“妇儿疾病与出生缺陷”教育部重点实验室，“早期发育与损伤的基础与临床嵌合研究”教育部长江学者创新团队。妇科恶性肿瘤诊治、小儿血液病及小儿肿瘤诊治、早产儿支气管肺发育不良防治体系的建设与完善为卫生部临床学科重点项目。全国救治农村儿童白血病、先天性心脏病区域协作中心、中国出生缺陷监测中心、全国妇幼卫生监测办公室、国家药物临床试验机构、卫生部四级妇科内镜手术培训基地、专科医师培训基地、临床药师培训基地、儿科专业临床药师培训基地、全国产前诊断超声影像技术骨干培训基地、四川省妇产科质量控制中心、四川省儿科质量控制中心、四川省产前诊断中心、四川省NICU专科护士培训基地和四川省产科母婴护理专科护士培训基地等均设在医院。2008年医院西部妇幼医学研究院正式挂牌。医院承办《中华妇幼临床医学杂志》（电子版）（中国科技核心期刊）、《国际输血与血液学杂志》两本国家级杂志。