乌鲁木齐儿童医院（前身为乌鲁木齐市第一人民医院），成立于1934年2月，1988年经自治区卫生厅批准改建为儿童医院，1997年正式命名为乌鲁木齐儿童医院。
乌鲁木齐儿童医院总院位于乌鲁木齐市天山区健康路，占地面积1.2万平方米，分院位于乌鲁木齐市新市区河南东路，占地面积2.73万平方米。七十余年的医疗实践，几代医疗精英的不懈努力，使儿童医院成为全疆唯一一家集医疗、教学、科研、预防、保健、康复为一体的综合性儿童医院，是国家级爱婴医院、自治区级文明单位……
乌鲁木齐儿童医院目前形成了以小儿内科系统（如呼吸、消化、内分泌，心血管、肾病、血液、神经、康复、新生儿等）；小儿外科系统（如普外、新生儿外、骨科、神经外、泌尿外、眼耳鼻喉、小儿妇科等）；小儿医技检查诊疗系统（纤维支气管镜、电子胃镜、结肠镜、肺功能监测、脑电诊断、心电诊断等）以及小儿院前院内急救和重症监护系统等多个系统组成的“院有专科，科有特色”的多元化格局。创造了儿科疾病专业特色的众多第一。