三亚市妇幼保健院始建于1952年，原名崖县保健站,1984年更名为三亚县妇幼保健所，1995年升格为地级市妇幼保健院（副处级单位）。在市委、市政府的关心和支持下，在上级卫生主管部门的领导下，保健院的规模不断扩大，在基础设施，人员队伍建设，医疗技术水平和设备等方面得到了很大的发展。 
三亚市妇幼保健院地处三亚市中心,环境优美,交通方便,是海南省第二大城市唯一一所妇幼保健医疗机构。全院占地面积3700平方米（5.7亩）建筑面积12140平方米，其中业务用房面积5800平方米。职工168人，卫生技术人员128人，占职工总数的76%，其中高级职称4人，中级职称36人，初级职称87人。拥有编制病床100张。
三亚市妇幼保健院设置行政职能科室9个（办公室、医务科、护理部、保健部、门诊部、人事科、总务科、财务科 、信息科）；一级业务科室7个（妇女保健科、儿童保健科、生殖健康科、健康教育科、妇科、产科、儿科）；二级专业科室19个（院办感染控制办、院内女职工保健室、婚姻保健室、更年期保健室、围产保健室、乳腺保健室、产后康复室、集体儿童保健室、儿童生长发育监测室、儿童心理卫生室、儿童营养室、妇幼保健培训中心、新婚学校、孕妇学校、妇科门诊、计划生育门诊、产科门诊、高危产科门诊、儿科门诊）；医技科室及其他科室8个（药制科、检验科、影像诊断科、功能检查科、手术室、麻醉科、消毒供应科、医疗器械科病案统计图书室）。
三亚市妇幼保健院拥有一批先进的专科医疗设备：全自动血球计数仪、全自动尿十项测定仪、自动生化仪、酶标仪、进口B超、 阴道B超、可视人流系统、宫腔镜、X线机、胎心监护系统、新生儿自动耳声发射听力筛查仪、婴儿培养箱、蓝光治疗仪、红外线乳腺诊断仪、阴道镜、YS-1型多系统电脑治疗仪、儿童保健电脑箱、麦卡锡智测箱 等。目前,我院妇产科开展的项目有妇产科内分泌及肿瘤的治疗，产科孕早期诊断以及围产期保健、高危孕产妇的处理等,开展的手术有全、次宫切除术、 新式剖宫产、附件肿瘤切除、腹腔外剖腹产等各种妇产科手术,高危孕产妇的抢救 。儿科、新生儿科开展的业务项目有内儿科、新生儿科常见病、多发病、各种疑难危重急症的诊断治疗和抢救工作。医院领导班子以全新的管理观念带领部分职工励精图治、开拓进取。医院现已基本发展成为一所集保健、医疗、教学、培训于一体的二级妇幼保健院。
三亚市妇幼保健院始终坚持“以保健为中心，以保障生殖健康为目的，保健和临床相结合，面向基层，面向群体”的妇幼卫生工作方针，突出专科特色，积极探索妇幼卫生服务机制,深化改革，强化管理，在业务建设上，医院始终以“发挥优势，树立特色,拓宽渠道,综合发展”为指导思想，不断引入竞争机制，加强硬件建设和软件管理，医院的综合实力有了很大的提高。2000年以来，门诊人次数、住院人次数每年均以20%的速度增长,业务收入逐年增加，综合服务能力 不断增强。