蛋白质与RNA结合的机制。众所周知，某些蛋白质只能结合具有特定序列的RNAs。而另一些蛋白质则被认为是“非特异性的”，因为它们在看似随机的位点与RNAs发生相互作用。然而在Nature新文章中，凯斯西储大学研究小组证实，非特异性蛋白事实上能够明确它们结合RNA的位置——找到并结合特定的核苷酸序列。

    论文的共同资深作者、凯斯西储大学医学院RNA分子生物学中心教授Eckhard Jankowsky说：“看来似乎并没有特异性蛋白和非特异性蛋白之分；实质上，它们都是特异性的。它们只是以不同的方式利用了它们的特异性。我们的研究结果增进了对于蛋白质和核酸控制基因表达机制的了解，促成了对于在癌症、病毒感染和其他疾病中这种控制丧失或改变机制的一些新认识。”

    该研究小组开发了一种新方法来检测蛋白质与成千上万不同RNA分子的结合，他们将这种方法命名为High Throughput Sequencing Kinetics (HITS-KIN)。这一方法适应于许多的生物学领域，使得研究人员能够对DNA或RNA的蛋白质结合位点上大量的突变进行快速地分析。利用HITS-KIN，科学家们可在数天内完成过去需要几年时间才能做完的实验。

    “通过结合传统的生化方法和新一代测序技术，现在我们能够一次实验分析上千上万种不同的RNAs，而此前我们只能局限地一次分析一种RNA分子，”论文的共同资深作者、凯斯西储大学医学院生物化学副教授Michael E. Harris博士说。DNA和结合蛋白互作缺陷是许多人类疾病，包括癌症和神经退行性疾病的基础。了解分子的互作机制是朝着开发出人类疾病治疗新策略迈出的重要一步。

    “这些新研究发现为针对在缺乏特异识别序列的位点与DNA和RNA结合的这类蛋白，设计出靶向药物指明了一些新方向。过去，我们并不知道这些蛋白质是如何识别结合DNA或RNA的位置的，这妨碍了设计靶向这种活性的药物。该研究还表明，新一代测序技术可以加深我们对于这些蛋白质以及它们控制细胞内部运作机制的理解，”国立卫生研究院下属国家综合医学研究所Oleg Barski博士说。

    Jankowsky和Harris利用HITS-KIN分析了了大量不同的RNAs与一种特殊蛋白质的结合紧密程度。研究人员发现非特异性蛋白不仅如预计的那样以相似的亲和力结合所有的RNA序列，且非特异性蛋白具有与特异性蛋白同样广泛的结合亲和性。