英国人及临床实践中最常见的遗传性血栓形成倾向为凝血因子 V 基因 Leiden 突变。因此，有关凝血因子 V 基因 Leiden 突变的流行病学信息也远多于其它类型的遗传性血栓形成倾向，其患病率在不同种族间也不尽相同。在欧洲白种人中，其患病率约为 3%-7%，在某些地区甚至更高，如瑞典南部。

    对于这部分人群相对较高的患病率，有研究者认为杂合子状态具有生存优势的原因或许在于减少了分娩或创伤后的出血，但这种说法尚未得到证实。地中海和中东地区的患病率与欧洲相似。但凝血因子 V 基因 Leiden 突变在东南亚、日本、撒哈拉以南非洲和澳大利亚土著人群中基本未发现。估计欧洲人群中纯合子凝血因子 V 基因 Leiden 突变的患病率约为 1/1600。

    凝血因子 V 基因 Leiden 突变的多态性为错义突变。这种突变的结果为活化凝血因子 V，这种凝血因子的活性弱于正常蛋白质 C 激活的凝血因子 10 倍以上（称为 APC 抵抗），从而导致凝血酶产生增加。这种激活蛋白质 C 抵抗的实验表型最初由荷兰莱顿大学的研究人员确定。

凝血因子 V Leiden 基因杂合子携带者一生中 VTE 的风险是非携带者的 3 到 5 倍。但绝对风险较低，部分人群到 65 岁为止只有 5% 出现 VTE，这反应了这部分人群 VTE 的背景风险，这种风险有年龄依赖性，每年平均 1000 人中有 1 人受此影响。约 20% 首次出现无明显诱因的患者为凝血因子 V Leiden 基因杂合子携带者。

    凝血因子 V 基因 Leiden 突变是深静脉血栓形成和肺栓塞的的危险因素，但对前者的危险程度大于后者，相关原因仍未明确。凝血因子 V Leiden 基因纯合子携带者发生 VTE 的风险是是非携带者的 10 倍或 10 倍以上，但这部分人群并不常见，对 VTE 总体负担所占的比例也较小。

既往研究发现，VTE 的危险因素之间具有相互作用，特别是服用结合激素避孕药、激素替代治疗或妊娠之间。例如，一项来自病例对照研究的数据显示，结合激素避孕药使用者发生深静脉血栓的风险是未使用者的 4 倍，而使用结合激素避孕药的凝血因子 V Leiden 基因杂合子携带者发生深静脉血栓的风险是未使用结合激素避孕药非携带者的 30 倍。激素替代治疗发生深静脉血栓风险的同样也有升高。

    然而，对于服用结合激素避孕药的凝血因子 V Leiden 基因携带者（占 5%），其发生 VTE 的绝对风险仍然很小（每年约为 15-30/10000 女性），不足以展开大规模筛查。