抗物种天然抗体、补体系统、内皮细胞三者被称为异种移植的三大免疫学屏障。三者之间虽然相互作用，但最新研究表明以补体系统被激活最为关键。

    1、补水系统 

    受体的补体系统直接被供体器官内皮细胞抗原所激活，而不需要天然抗体参与反应。这种形成的补体激活似乎是通过替代途径完成的，并且是受体的循环抑制蛋白与供体内皮细胞表面分子基因不良反应的结果。

    2、天然抗体 

    机体内存在着天然抗物种抗体，这种天然抗体在移植术后很快与供体器官内皮细胞表面的移植物抗原发生特异性反应，从而导致补体系统激活，此种补体系统反应称为经典途径。其结果为异种移植物很快从内皮细胞起，呈现广泛的超急性损伤。

    3、内皮细胞

    现已比较明确，静息状态的内皮细胞形成一层很薄的单层膜，作为组织与血细胞、血浆及蛋白质之间的屏障。这种静息状态内皮细胞既不能激活凝集素，也不能激活中粒细胞的附壁作用。当内皮细胞与IL-1、肿瘤坏死因子、内毒素等物质接触时，即发生一系列代谢和结构的改变，这一过程称之为内皮细胞激活。激活的内皮细胞与静息时相反，它可以促进血小板凝集、产生纤维蛋白、诱导中粒细胞附壁，激活的内皮细胞单层间的结构改变也使其对血浆蛋白和血细胞的通透性增加。观察表明，异种移植时，受体的物种天然抗体和补体均可激活内皮细胞产生上述连锁反应。

    除以上所述三大屏障之外，特别值得一提的是供体上皮细胞的补体抑制蛋白系统，供体器官内的补体抑制蛋白，由于物种间的结构差异，不能移植受体补体系统的活化过程，即该蛋白不相匹配。此时，补体的激活时自发性的，如上述屏障之一所述，或是抗体介导式的。熟悉这一机制对理解用转基因动物作为供体为什么会避开超级性排斥反应很有帮助。