鉴定成体干细胞需要多种手段。通常，人们利用已知的分子标记在活体组织中对细胞进行标记，确定他们可能存在的部位，然后用莆系追踪方法验证由这些干细胞所产生的特定细胞类型;也可以利用物理或化学方法，将成体干细胞从活体分离出来，在体内进行标记后，这些细胞还可以被移植入另一个动物体内，已验证这些干细胞是否具有生成其来源组织的能力。

　　在干细胞研究中，单个成体干细胞可以诱导产生一系列遗传特征相同的细胞，称为细胞细胞克隆。这些细胞可以定向分化称为组成来源组织的各种类型的细胞。在细胞培养中，单个干细胞可以产生细胞克隆，或者单一类型的干细胞群可以在被移植入动物体内后再生成相应组织。克隆形成也是干细胞研究中评价干细胞的指标之一。