研究发现，毛宁干细胞位于毛囊中点下方，毛球外的区域，该区域在立毛肌囊附着处捎深部位，相当于毛囊隆突部，毛囊富含增殖能力较强的表皮细胞，资料显示1mm头皮平均约含3个毛囊，可含有3000-6000个该种细胞，而在1mm2五毛发表皮内仅含1000-2000个。毛囊干细胞具有双向分化潜能，即可形成表皮，又可形成毛囊。

　　此外，毛囊也由此成为干细胞研究的模板。在正常生理条件下，毛囊干细胞是生长初期毛发循环再生的一个细胞库，此外，她们也能再生受损的皮脂腺和表皮。最近，有研究表明毛囊干细胞喝黑色素细胞以及其他类型的间充质细胞紧密联系共同形成了毛囊干细胞的特殊微环境，对皮肤创伤再生具有重要的作用。因此，毛囊及其邻近的组织是干细胞微环境研究的重点。有人更是猜测毛囊干细胞具有多能干细胞的特征，是再生医学的一个重要的潜在种子细胞。但目前围绕这毛囊干细胞还存在不少疑团，比如它的分化潜能、特异性分子标记以及相关微环境等。

　　最近一项研究表明成人毛发生长初期外根鞘有1个特别的转节结构，这个结构中富含毛囊干细胞，是为成人的毛囊突起结构。研究表明C8/144B单克隆抗体能结合毛囊角质细胞的K15分子。因此可以利用此方法来标记毛囊突起区域。此外，CD200也可以作为毛囊干细胞的分子标记。

　　毛囊突起区的细胞表现出非常的克隆形成能力，这表明这些细胞可能具有多向分化潜能。细胞命运实验结果表明毛囊突起细胞能产生外根鞘、毛囊基质和髓质细胞。对毛囊突起细胞的K15基因启动子进行荧光示踪，结果表明毛囊突起来源的细胞分布其下上皮、毛干、表皮等结构中。