组织转分化的过程中，来自细胞内外的诸多不同因素，可以通过触发转分化的启动、促进原有分化特征的消失及新分化特征的表达等途径，来调节转分化的发生。研究这些因素对转分化的作用有利于深入揭示转分化的机制。

　　首先，细胞从多细胞组成的组织正常环境中分离出来是触发转分化过程的重要因素。如蝾螈晶状体再生，虹膜色素上皮必须与间充质细胞构成的包膜分离，才能开始其向晶状体转分化的过程，而间充质包膜、胞间链接均可组织转分化的启动。若在蝾螈晶状体被摘除后，用一些具有类似胰蛋白酶作用的药物处理其眼睛，破坏细胞间的连接及组织的正常结构，将导致晶状体的再生出现异常。细胞从正常组织的脱离还涉及某些表面特性的改变，如蝾螈在行晶状体摘除术后，虹膜色素上皮细胞在超微机构、电荷密度及凝集素附着等方面存在明显的改变。糖蛋白2NI-36存在于包括虹膜色素上皮在内的多种组织细胞的表面或胞外基质中，具有保持原分化特征的作用，随着其表达的降低可促使细胞表达新的分化特征的潜力得以表现。

　　其次，细胞转分化启动后转分化过程的维持仍需要细胞继续保持与正常生长环境的脱离状态。如避免细胞连接的重新建立可维持转分化的进行。细胞于胞外基质的相互作用能抑制其转分化的发生，因此，细胞与特定的胞外基质成分的脱离也是保证其分化过程持续进行的重要因素之一。如将分散解离的视网膜色素上皮细胞分别培养于胶原和塑料基质上，虽生长速度基本一致，但培养于胶原的细胞仅保持原有分化特征。

　　此外，转分化启动后，胞外基质分子、细胞分裂次数以及与细胞信号转导相关的分子等多因影响着转分化的路径的选择。将蝌蚪视网膜色素上皮细胞培养于层黏连蛋白及胶原这两种不同的胞外基质成分上，细胞转分化的方向明显不同，前者转分化为神经视网膜细胞，候着则转分化为晶状体。人们已经证实细胞核分裂的次数为爪蟾发育早期分化特异性基因的表达所必须。进一步研究发现细胞周期的活动与组织再生中转分化的发生密切相关，可影响组织再生过程中细胞转分化途径的选择。目前认为细胞周期次数影响转分化的机制是细胞周期的循环过程中细胞的状态发生了改变，基因转录机制也随机出现变化，如某些特定的基因发生甲基化，导致与转分化相关的基因组转录的启动。