在常规HE染色的切片中只能看到较粗大的神经束和Meissner触觉小体等特征性结构，而纤细的神经末梢则需用一些特殊染色方法来显示，例如银浸法、胆碱酯酶染色，还原型烟酰胺腺嘌呤二核苷酸磷酸黄递酶（NDAPH黄递酶，NDP）和亚甲蓝厚片漂染等方法。除组织化学研究方法外，也可进行（免疫）电镜超微结构观察。此外，还可采用神经电生理信号记录、神经微电极记录和药物反应性的检测等方法以研究神经传导功能。

　　采用神经相关蛋白和神经肽等特异性抗体进行免疫组化染色是研究神经结构和功能最常用的方法。其识别标记包括：蛋白基因产物（PGP）9.5、S-100、波形蛋白、P物质、血管活性肠肽、降钙素基因相关肽（CGRP）、乙酰胆碱（ACE）、生长抑素、脑啡肽和多巴胺β羟化酶等。其中，PGP 9.5属于神经泛素羟基末端（C末端）水解酶，采用该标记物不仅能显示表皮下神经丛、真皮神经干和汗腺周围的神经末梢，还可清晰地观察到正常表皮内浓密而健康的神经轴突分布。

　　近年来，将免疫组化与共聚焦激光显微技术和（或）计算机图像处理方法结合，已能清晰显示细微无髓神经的图像，甚至是完整器官内无髓神经网络样排列。