角质蛋白K15的阳性表达区域多位于毛囊隆突处及基底膜钉突附近，且角质形成细胞在分化过程中K15的表达量逐步降低。K19的高表达区域多与β1整合素的高表达区相一致。但两者由于缺乏明显的特异性，因此对鉴别表皮干细胞只能起辅助作用。角蛋白是表皮细胞的结构蛋白，它们构成直径为10nm的微丝，在细胞内形成广泛的网状结构。

　　随着分化程度的不同，表皮细胞表达不同的角蛋白，因而角蛋白也可作为干细胞与分化细胞的鉴别手段。表皮干细胞表达角蛋白19，短暂扩增细胞表达角蛋白5和14，而分化的终末细胞则表达角蛋白1和10。

　　实验也证实，表皮基底层中K19与β1整合素表达均为阳性的细胞绝大多数属于标志保留细胞，具有干细胞的慢周期性。一般认为毛囊隆突部的干细胞及胎儿、新生儿表皮基底层干细胞均表达K19，成人无毛发皮肤如手掌、脚掌部位基底层的干细胞K19表达阳性，但有毛发皮肤基底层中的表皮干细胞K19则表达为阴性。又有实验发现毛囊隆突部表皮干细胞表达角蛋白15，而且在干细胞的分化过程中，K15表达的减少较K19表达的减少更早，K15阴性而K19阳性的细胞可能是“早期”短暂扩增细胞，故K15可能较K19在鉴别毛囊的隆突部表皮干细胞更有意义。