α6整合素

　　它是角质形成细胞桥粒结构的重要组成部分，介导着细胞与基底膜的粘附。研究表明，基底膜中α6整合素高表达且转铁蛋白受体低表达的细胞具有相对静止且能保持长期增殖的特点，被认为是干细胞。但也有相反的研究结果，显示α6β4的表达水平与细胞的增殖潜能无关。

　　P63基因

　　它与肿瘤抑制基因P53同族。在体外培养条件下，P63的表达只出现在具有高度克隆形成能力的表皮细胞中。而P63基因缺失的纯合子小鼠则不能形成复层结构的表达，推测这可能与皮肤中缺乏干细胞有关。但是，表皮细胞P63基因的阳性表达是否与β1整合素及α6整合素的高表达及转铁蛋白受体的低表达相关或一致。

　　连接蛋白43

　　它可以作为阴性标志物来对表皮干细胞进行相应的鉴定及筛选。该蛋白属于缝隙连接蛋白，存在于人类及鼠的表皮基底膜中。Matic等人的研究结果显示，Cx43阴性的表皮细胞仅占表皮细胞总量的10%，这与干细胞的数量相似，且细胞多为均一的小型细胞，具有较高的核浆比。此外，更为重要的是绝大多数标记保留细胞均为Cx43阴性细胞。