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我国研发高分辨“脑地图”可视仪
时间:2013-05-29 16:54:35  作者:网站编辑  来源:生物通
人类很久以前就会利用真菌做面包和啤酒了,却并不了解居住在自己身体上的真菌。日前,美国国立卫生研究院NIH的研究人员,首次解析了人类皮肤上的真菌多样性。他们对健康人不同皮肤部位的真菌DNA进行了测序,明确了皮肤上正常真菌群落的构成,为研究真菌类皮肤病打下了基础。文章于五月二十二日发表在Nature杂志上。

    人类很久以前就会利用真菌做面包和啤酒了,却并不了解居住在自己身体上的真菌。日前,美国国立卫生研究院NIH的研究人员,首次解析了人类皮肤上的真菌多样性。他们对健康人不同皮肤部位的真菌DNA进行了测序,明确了皮肤上正常真菌群落的构成,为研究真菌类皮肤病打下了基础。文章于五月二十二日发表在Nature杂志上。

    人类皮肤表面的真菌、细菌和病毒组成了一个复杂的微生物生态系统,称为皮肤微生物组。真菌生长慢而且难于培养,这大大影响了相关皮肤病的诊断和治疗。NIH旗下的人类基因组研究所NHGRI和癌症研究所NCI,对DNA测序技术进行了优化,在ABI 3730xl和罗氏454测序平台上对皮肤真菌群落进行了分析。

    研究人员发现,Malassezia属的真菌在头部和躯干占据优势。而在带有多种细菌的手部,真菌种类却相对较少。与此相反的是,脚部(包括脚趾甲、脚跟和脚趾)的真菌多样性非常高。研究人员希望,通过解析人体上的真菌和细菌生态系统,更好的理解相关皮肤病。

    研究人员在十位健康成年人身上收集了十四个部位的样本,并对样本中的真菌进行DNA测序。他们检测了被称为系统发育标记的DNA片段,以鉴别样品中真菌的种类。DNA测序技术最终生成了超过五百万个标记,代表了八十多种真菌。而传统的培养方法只能鉴定出18种真菌。研究人员指出,这是因为DNA测序可以检测到那些难于培养的真菌种类。

    研究显示,脚跟部感染的不同个体,具有相同的脚跟真菌群体。而对于脚趾甲感染而言,不同个体的脚趾甲真菌群体差异很大。研究人员还发现,Ascomycetes和Basidiomycetes真菌是14个部位上共有的正常真菌。所有健康志愿者的皮肤上都存在Malassezia真菌,这种最常见的真菌出现在11个部位上。

    “以DNA测序为基础的鉴定方法,能够解析皮肤上真菌群落的构成。我们发现,真菌多样性依赖于皮肤所在的部位,与取样个体关系不大,”文章的资深作者之一Heidi Kong说。“我们这项研究主要针对容易发生真菌性皮肤病的部位。”

    研究显示,脚部的真菌组成最为复杂,约有80种真菌,其他部位则比较少。研究人员将同一人身上的真菌多样性与细菌进行比较,发现手臂细菌多样性高而真菌多样性低,而脚部则刚好相反。另外,在身体主要部位的皮肤上,细菌和真菌的多样性都不高。

关键字:脑地图,可视仪
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