分子医学的核心任务是阐明人类疾病在分子、细胞和整体水平的生理、病理机制，并通过综合集成, 将有关成果转化为临床预测、诊断、干预和治疗的有效手段，增进人类健康。分子医学以“从分子到人”、多学科综合交叉、研究与应用并重为特色，是功能基因组时代生命科学发展的大趋势。
北京大学分子医学研究所（Institute of Molecular Medicine, Peking University, IMM PKU）创建于2005年。该所以心血管病和代谢综合征等重大疾病为主题，集基础、转化、前临床研究为一体，秉持从分子到疾病模型到人“一条龙”的研究战略，进行分子机理和转化医学的研究。
未名湖畔，博雅塔边，IMM已建成了具有国际水准的12个研究室和研究中心、3个大型公共科研平台，其中包括国际知名的“非人灵长类研究中心”。在II期发展规划中，IMM将建成25个实验室和研究中心，强调深层次合作、协同创新与集成创新，以“兼容并包、追求卓越”为己任，开展代谢与心血管转化医学研究。核心宗旨是解决事关中国国计民生的重大生物医学课题，培养“创新型、复合型、学科交叉型”领军人才。
