石河子大学附属医院坐落在石河子市东区，东临国家级石河子经济技术开发区，西临石河子大学医学院，北临石河子大学中心区。始建于1949年，是全国农垦系统最大的一所集医疗、教学、科研、预防、保健、康复、急救为一体的综合性“三级甲等医院”、“全国百佳医院”、“全国百姓放心医院”，是兵团卫生系统医疗、教学、科研的中心。 
　　作为兵团及自治区范围内最重要的医疗、教学、科研以及卫生人才培养基地之一，医院占地面积24万平方米，建筑面积近13万平方米，开放床位1200张，设32个临床科室，20个临床教研室，11个医技科室，门诊部及其它辅助业务科室，是兵团肝胆外科中心、兵团关节镜中心、兵团内窥镜中心、以及兵团心脏介入起搏诊疗中心、肿瘤放射治疗中心，自治区护理质量控制中心和自治区病理质量控制中心。06年，医院新增设了质量控制办公室、对外交流办公室、肿瘤内科、医疗服务咨询中心等机构，不仅完善了医院的机构建设，而且方便了患者。医院年门诊量44.6万人次，年住院量2.66万人次。全院现有职工1284人，其中专业技术人员1129人，具有高级职称专业技术人员186人，中级职称440人，享受政府特殊津贴的优秀专家19人，硕士研究生导师55人，已培养和正在培养的脱产和在职博士、硕士研究生达145人。医院每年承担着石河子大学医学院、成人教育学院、科技学院及护士学校等医学类课程2万余课时的临床教学任务，是石河子大学医学院的研究生培训基地，现有外科学、内科学、妇产科学、眼科学、肿瘤学、麻醉学等六个专业学科拥有硕士学位授予权。至2006年底，医院固定资产达2.7亿元。 
　　石河子大学附属医院设备先进，拥有美国GE Hispeed NX/i多层螺旋CT、美国GE Signa1.5T核磁共振仪(MRI)、美国GE Prucka Cardio Lab4000型32导电生理仪、KODAK DR7100型DR、 KODAK PACS影像系统、美国GE Lcv+数字减影血管造影机（DSA）、德国ERBE10139-000型螺旋水刀、日本奥林巴斯LUCERA电子内窥镜、美国史赛克宫腔镜、日本奥林巴斯VISERA腹腔镜、美国史赛克腹腔镜五套、美国史赛克关节镜两套、美国史赛克胸腔镜一套、美国史赛克耳鼻喉镜一套、美国枢法模椎间盘镜一套、日本全自动生化分析仪、爱尔博电外科工作站、美国GE SYSTEM FIVE彩色多普勒心脏超声诊断仪等大型高精尖诊断治疗仪器，为医院的医疗、教学、科研工作提供了有力的保证。2006年底，医院专业设备总金额达到1.2亿元。 
　　石河子大学附属医院坚持科技兴院，着眼于长远发展，注重不同年资、不同学历层次、不同专业的人才培养，近五年来，每年投入人才培养经费110余万元，同时采取多种方式大力吸引高层次医学人才。近年来,累计引进和培养医学博士28人，硕士研究生129人。人员素质的提高大大促进了科研工作的发展，近五年来，医院完成科研成果95项，其中7项为国内领先或先进水平，20项成果获省、市科技进步奖，3项国家专利，全院开展新项目、新技术110项，出版专著17部，在全国各类各级公开出版的杂志发表学术论文964篇。经过多年的不懈努力，医院的普外科、消化内科、心血管内科、中医科已成为石河子大学重点学科。其中，肝包虫囊外摘除术、肝纤维化临床诊断与研究、消化内镜的临床应用、关节镜的临床应用与研究、腹腔镜在泌尿外科的应用与研究、腹腔镜在妇科疾病的应用、宫腔镜的临床应用等技术在疆内居领先水平。