研究分子育种的小伙伴有没有过这种疑惑：样本量已经很大，群体设计的很完美，做了大量测序工作，还是找不到性状关联基因?参考基因组不好用?参考基因组跟研究的品种差异太大?

　　其实绝大部分原因是因为：与该性状相关的基因，在参考基因组中不存在;性状相关基因很多是处于高变区，变异极大，使用传统的方法难以鉴定，无法将性状与之关联。由农业部农业基因组学学科群发起的“重要农作物参考基因组计划研讨会”上，专家指出：“单个基因组已经无法代表不同个体自身的基因组特征了，相同物种不同品系、不同群体间的差异往往会影响个体所呈现的性状。”这提醒我们如果想要充分挖掘遗传资源信息、全面探究物种进化及作物适应机制的话，需要组装构建物种的泛基因组或多个基因组信息。针对于分子育种领域这样的发展趋势，博奥晶典linked-reads建库搭配二代测序的测序服务应运而生。相对于二代和三代测序，10X Genomics基因组测序质量高、组装效果好、周期短。相对于三代做单个基因组的成本，可用10X Genomics测多个基因组数据，性价比更高。那么对于已经发现的几万到几十万个有意义的标记，如何高效利用呢?各位老师在这时候肯定希望可以有更加稳定(重复性好)、准确、快速、性价比的集成化工具;不需要特别大的服务器等硬件支持，可以比较容易的做些数据分析;做自己的研究(如：全基因组选择)或应用(如：品种资源鉴定)。

　　通过重测序或De novo获得SNP位点信息，之后可定制SNP检测芯片，一方面通过QTL定位、GWAS、选择信号分析等策略找到与性状相关的SNP标记位点，用于分子标记辅助育种。另一方面在全基因组水平采用基因组选择方法进行分子育种。