诱导多能干细胞(iPSCs)即将成体细胞重编程，令其恢复到胚胎干细胞的状态，这种细胞在治疗方面具有极大的潜力，如可以治疗受损神经，再生肢体和器官，以及为患者特殊疾病提高完美的模型。但是通过目前的重编程过程得到的细胞会出现严重的遗传和表观遗传异常，这些异常降低了细胞的质量，也限制了它们在临床上的治疗用途。

    最近，一组来自Whitehead研究院的研究人员与来自希伯来大学的研究人员合作，解析了重编程因子本身对于重编程效率和细胞质量的影响，这一研究成果公布在Cell Stem Cell杂志上。

    “博士后研究员Yosef Buganim与Styliani Markoulaki等人发现了一个不同以往的组合重编程因子的方法，虽然重编程效率会降低，但是得到的细胞质量极大提升，”文章作者，麻省理工生物学教授Rudolf Jaenisch说，“细胞质量也是一个非常重要的问题。在这一点上，从一万个细胞中得到一个克隆，和从十万个细胞中得到一个克隆没有区别，只要它的质量高。”

    为了构建iPSCs，科学家们首先给成体细胞加入胚胎干细胞中取得的混合基因，然后iPSCs就能分化成几乎任何一种细胞类型，比如神经细胞、肝脏细胞或肌肉细胞。虽然最初的配方：Oct4、Sox2、klf4和Myc(OSKM)能有效的进行细胞重编程，但是这样得到的细胞具有严重的基因畸变，包括非整倍体和8号染色体三体，因此不适合用于临床研究。

    因此Buganim 和Markoulaki尝试利用生物信息学分析重编程过程中关键的48个基因，结果他们设计出了一种新型的基因组合：Sall4, Nanog, Esrrb, and Lin28 (SNEL)。

    通过这种SNEL方法，研究人员能得到大约80%的高质量小鼠细胞克隆，并且这些细胞也通过目前最严格的多能检测测试：四倍体互补分析(tetraploid complementation assay，生物通译)。而对此相比，OSKM方法只能得到20-30%的高品质通过检测的细胞。

    Buganim认为SNEL重编程之所以质量更好的原因在于，这种混合配方不是依赖于潜在致癌基因Myc，这种基因会引起许多遗传问题。而且更重要的是，这种混合配方也不依赖于潜在的主调控因子Oct4和Sox2，这两个基因有时会异常激活成体细胞基因组中某些区域。

    为了更好的理解为何一些重编程细胞质量高，而另外一些则质量低，Buganim 和Markoulaki又在遗传和表观遗传水平上分析了SNEL克隆。研究人员发现SNEL细胞DNA的组蛋白H2AX积累位置，与胚胎干细胞中位置十分相似，而且H2AX的位置似乎也预示着细胞的质量。研究人员相信这种特质能用于高质量克隆快速筛选。但是就目前的SNEL细胞来说，还不能用于人类细胞重编程，因为人类细胞要比小鼠细胞更难以操控。

    “我们知道SNEL并不是理想的重编程因子组合，” Buganim说，“这项工作只是从理论上证明我们能发现理想的组合，SNEL的发现表明通过生物信息学工具，我们能得到更好质量的细胞。现在我们就能进一步寻找优化的组合，并在人类细胞中进行实验。”