近日,干细胞领域著名期刊cell stem cell在线发表了美国贝勒医学院研究人员的最新研究进展,他们发现长非编码RNA能够调控造血干细胞的自我更新和谱系分化,为造血干细胞的基因调控研究提供了新的见解。
造血干细胞具有其独特的基因表达程式,增强其干细胞特性,调控谱系分化发育过程。长非编码RNA(lncRNA)作为重要的调控因子在基因表达和细胞命运决定方面发挥重要功能,但其在造血干细胞中的功能仍不清楚。研究人员通过对纯化的造血干细胞进行深度测序和转录组分析,发现了323个从未报道过的lncRNA。对比它们在分化谱系中的表达情况,研究人员证实有159个lncRNA在HSC中表达水平较高,其中一些似乎具有HSC特异性表达。
这些lncRNA基因与蛋白编码基因具有类似的表观遗传特征,包括DNA甲基化对其表达的调控过程,并且通过对HSC特异性表达的两个lncRNA进行敲低发现其对HSC自我更新和谱系分化发育具有不同影响。研究人员对其中一个候选lncRNA进行基因组结合位点匹配分析,发现其基因组结合位点集中在造血干细胞关键转录因子的结合位点处,特别是E2A。
总的来说,这些结果表明长非编码RNA在调控HSC自我更新和谱系分化方面发挥了重要作用,为通过基因方法调控HSC功能提供了新的见解,具有重要意义。