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生物技术公司角逐数据库开发
时间:2013-04-16 10:02:41  作者:网站编辑  来源:39健康网
因分型,尤其针对易感基因或者疾病风险基因,与机体疾病存在密切关系,未来的健康预测可通过基因分型来评估

    因分型,尤其针对易感基因或者疾病风险基因,与机体疾病存在密切关系,未来的健康预测可通过基因分型来评估,如单基因遗传病和GWAS分析出的多基因遗传病,而以基因组序列为主体的遗传数据库为基因分型提供对比样本,有利于筛查致病基因和缩短研究周期。在遗传数据库开发的角逐中,Life Technologies参与了23andMe保持领先的竞赛。

    Oncomine Gene Browser这一新型工具让学术界和小医药公司科研人员在药物研发领域更具竞争力,科研人员将能访问十年来收集和整理的数据库,包括数千个临床研究和价值数百万美元的实验,这些将有助于他们设计出更有针对性的实验,并取得较快的研究进展。

    这是一个重大进步,因为肿瘤测序实验往往发现数百个变异序列,其中仅一小部分是真正的癌症驱动基因。在此之前,研究人员利用繁琐的文献检索或复杂的生物信息学方法从随从突变中辨别肿瘤驱动基因。经过Oncomine Analysis分析后,数千个肿瘤患者样本呈现出增益功能或功能丧失的两大分类,这让肿瘤研究人员即刻识别出他们样本中的驱动基因。

    23andMe在个体化诊断领域可谓是风生水起,它测序的对象已达18万之多,这些遗传数据库足以确保23andMe在数据库构建方面的领先地位,并为基因分型诊断提供了遗传信息支持。

 此外,该公司开放数据库API 后将提供一次让用户共同挖掘遗传数据库的机会,尽管 23andMe在探索 DNA 上已创造了不少突破性的创新工具,但 API的授权将激发其它机构共同开发新的、基于web 的交互工具。在不侵犯用户隐私权的前提下,如果能够成功,23andMe遗传数据库的挖掘信息可以更加丰富化,此外,行业认可度也会随着过多机构参与而提高。

 从谷歌风投看遗传数据库的前景

 谷歌风投公司,作为敏锐风险投资方,将总金额1亿美元的募集款的一部分投入到生物医药产业的八家公司,其中四家属于遗传数据库领域,足以见证遗传数据库在医疗领域的前景。这四家公司分别是DNAnexus、Flatiron Health、Predilytics和Wingu。

 DNAnexus:成立于2009年,总部加州山景城,创立者是斯坦福大学计算机科学副教授Serafim Batzoglou,病理和遗传学副教授 Arend Sidow,以及计算机科学家 Andreas Sundquist。这家公司为基因组测序提供云计算支持。Flatiron Health:成立于2012年,总部纽约,创立者是Nat Turner和Zach Weinberg,两名非常年轻的工程师,他们曾经把一家技术公司卖给谷歌。Flatiron Health给肿瘤研究和临床提供数据平台。Predilytics:成立于2011年,总部波士顿,创立者Christopher Coloian。这是一家IT公司,提供针对医疗健康市场的评估等服务。Wingu:成立于2009年,总部麻省剑桥,创立者Nick Encina和 Brian Gilman,为医疗健康提供数据分析平台。

关键字:生物技术,据库开发
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